Detección de variantes patogénicas mediante la tecnología NGS en genes asociados a Leucemia Mieloide Aguda

Abstract

Trabajo presentado en las 15º Jornadas Científicas y de Gestión del Hospital de Alta Complejidad en Red El Cruce Dr. Néstor C. Kirchner realizadas durante los días 19, 20 y 21 de Octubre del 2022 en Florencio Varela, Buenos Aires, Argentina.

RESUMEN: Introducción y objetivos: Las leucemias mieloides agudas(LMA) representan una colección de neoplasias mieloides con marcada diversidad y heterogeneidad genética, etiología diversa y potencial evolución clonal entre los pacientes. Estas neoplasias infiltran la médula ósea(MO) y en ocasiones, otros órganos o sistemas. Su frecuencia aumenta con la edad representando hasta el 80% de las LA del adulto. El diagnóstico de laboratorio se lleva a cabo mediante análisis de MO o sangre periférica (en el caso de hiperleucocitosis) para la evaluación citomorfológica, citoquímica, inmunofenotipo y perfil citogenético-molecular. El estudio de mutaciones en paneles multigénicos mediante tecnologías de secuenciación masiva como next-generation sequencing (NGS), de reciente incorporación en nuestro Hospital, resulta potencialmente útil para evaluar pronóstico, estratificación de riesgo y toma de decisiones clínicas. El objetivo de este trabajo es describir el espectro de genes afectados en pacientes con LMA, indicar los mecanismos de acción más afectados y señalar aquellas variantes factibles de intervención con terapias diana.

Métodos: Fueron incluidas 26 muestras de MO y sangre periférica de pacientes adultos con diagnóstico de LMA de novo, recaídas y secundarias, atendidos en el HEC durante el período Agosto2018-Abril2022.Se analizaron genes conocidos por su compromiso en LMA, mediante NGS a través de AmpliSeq™for Illumina®MyeloidPanel.

Resultados: Se encontraron 76 variantes patogénicas en total, con un promedio de 3 por paciente.Se analizaron asociaciones entre ellas representadas en la Imagen 1.Los mecanismos más afectados fueron: metilación del ADN(47%) y factores de transcripción(17%). N=9 mutaciones (genes IDH1/2 FLT3 NRAS y KIT) son factibles de terapia.

Conclusiones: El perfil mutacional observado es muy heterogéneo debido a la variedad de clones involucrados en la enfermedad.Contar con esta tecnología es importante ya que nos permitió detectar variantes patogénicas y su asociación entre ellas, viendo la vía más afectada. Además permitió detectar aquellas que pudieran ser en un futuro tratadas con nuevas terapias dirigidas.Se necesitan más estudios para categorizar las variantes de significado incierto.